Ответ:
Скорее всего все дело в вентиляции цоколя, если конечно он у вас вентилируемый как положенно. Обычно в чакстных домах вент отверстия на зиму закрывают а весной с потеплением открывают. Выйдите на улицу пройдитесь по периметру цоколя и найдете эти отверстия, ну и за тем просто закройте их чем нибудь от сквозняка, только весной потом незабудьте открыть.
Могу предположить только один ответ по этому поводу. В своё время я много работал на стройках частных домов и насмотрелся всякого. И как не странно одна из причин холодного пола кроется в безалаберности строителей. Если заставляют строить быстро, то зачастую после укладки плит перекрытия просто напросто «забывают» заделать пустоты. Вот и получается, что зимой в пустоты заходит мороз и промораживает плиту, а с ней и полы. А вот как теперь проверить Вам мою догадку я даже и придумать не могу, ведь добраться сейчас до торцов плит просто не реально.
В любом жилом частном доме всегда строятся технологические проемы которые называются продухи их может быть несколько. Так вот возможно Вы о некоторых не знаете или забыли их с приходом зимы необходимо закрывать тем более Вы пишите что теплоизоляция хорошая. Значит основная проблема в подаче морозного воздуха под пол. Если они закрыты то необходимо проводить комплексную проверку с применение тепловизора, это единственный выход найти откуда попадает холодный воздух. Затем все заделать. Более конкретно сказать трудно причин может быть десятки.